糖基化定量蛋白组学研究
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北京百泰派克生物科技有限公司
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BTP-糖基化定量蛋白组学研究
糖基化修饰不仅影响着蛋白质的空间构象、生物活性、运输和定位,在分子识别、细胞通信、信号转导等特定生物过程中发挥着至关重要的作用。糖蛋白根据其糖链结构及糖基化位点主要有N-糖蛋白与O-糖蛋白两大类。据推断,有超过50%的蛋白质都发生了糖基化修饰,但由于糖基化的高度复杂性,绝大多数糖蛋白尚未被发现,现有数据库中只有约10%的蛋白质被注释为糖蛋白。仅仅由6个不同单糖组成的寡糖链,其结构就可能达到惊人的1012种。
百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,推出糖基化定量蛋白组分析服务技术包裹,您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、糖基化肽段富集、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。
随着质谱分辨率的不断提高和生物信息学的不断发展,质谱已广泛应用于糖基化解析,通常先利用酶切或化学手段将糖链从糖蛋白释放,再分别进行糖基化位点的鉴定和糖链结构的解析。然而针对完整糖肽的解析,目前尚无成熟技术。百泰派克公司利用新一代组合型质谱Orbitrap Fusion具有的HCD/ETD“双碎裂模式” 解析复杂糖蛋白的完整糖肽,然后利用Byonic软件对质谱原始数据解析,实现对N-糖基化位点和O-糖基化位点的鉴定,并对相应位点携带的糖链组成进行分析。
糖基化修饰研究路线
关于样品
1. 如果您提供的是组织样品,请您干冰将组织样品寄给我们;植物组织样本大于200mg,血液样品至少1ml(血浆注意用EDTA防凝),血清0.2-0.5ml,尿液2ml,动物组织样品至少1g,细胞样品为1X107个细胞,酵母、微生物等干重200mg。
2. 如果您提供的是蛋白样品,请您保证蛋白总量在100ug以上;蛋白提取时使用普通的组织、细胞裂解液即可。
3. 样品运输:请使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。
研究案例
该项目是某高校老师植物样品在百泰派克进行蛋白糖基化修饰位点鉴定。得到的部分结果如下图所示:
中/英文项目报告
在技术报告中,百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告,报告包括:
1. 实验步骤(中英文)
2. 相关的质谱参数(中英文)
3. 鉴定的糖基化位点的详细信息
4. 质谱图片
5. 原始数据
BTP-糖基化定量蛋白组学一站式服务
您只需下单-寄送样品 百泰派克一站式服务完成:样品处理-上机分析-数据分析-项目报告
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